本堂表欄間には「龍の彫り物」が施されており、山門には左甚五郎作とされる「龍の彫刻」も見られる。
　本堂は、妙法寺の法華堂を移築したもので、格天井の絵は、細川氏の絵師によるもの。
　上行寺は、桜田門外の変において、大老井伊直弼を襲撃した水戸浪士広木松之助が切腹した寺でもある。境内に松之助の墓がある。
　薬師堂には、北条政子が源頼朝の「おでき」を治すため参拝したという瘡守稲荷が祀られている。